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尸体剖检所观察的特征是急性肠炎,局限于空肠和回肠,炎症反应较轻,仅黏膜出现浊样颗粒化,有的可见整个黏膜的严重坏死性肠炎。眼观特征是黄色纤维素坏死性假膜松弛地附着在充血的黏膜上。乳糜的吸收随病情的严重性而变化。
显微镜下检查发现空肠和回肠的绒毛变短,约为正常长度的一半,其顶部可能有溃疡与坏死。在有些病例,坏死遍及整个黏膜,球虫内生发育阶段的各型虫体存在于绒毛的上皮细胞内,少见于结肠。在病程的后期,可能出现卵囊。
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