根据本病的流行病学、临诊症状和病理变化，即可做出诊断。
1、从流行病学特点看
猪支原体肺炎只有猪发生，任何年龄、性别、品种和用途的猪都可发病，但以小猪症状明显，死亡率高，体格健壮的猪只，只是偶有咳嗽声。
猪支原体肺炎以慢性经过为主，在新疫区可呈急性暴发；在老疫区多为慢性或隐性经过。在饲养管理不良、天气突然变化时，症状随之明显恶化，用一般药物治疗后，症状暂时消退，以后又能复发。
2、临诊症状 imuyi.com
以咳嗽和气喘为特征，体温、精神和食欲正常，病程较长。随着不良因素的影响，症状明显或加剧。
3、病理剖检
以两肺的心叶、尖叶和膈叶发生对称性的实变，中间叶实变，以及肺部淋巴结肿大、增生为特征，其他内脏器官无明显变化。
4、血清学诊断
血清学方法诊断猪支原体肺炎得到了发展，微粒凝集试验、间接红细胞凝集试验、微量补体结合试验、免疫荧光、ELISA等方法可用于诊断。
5、鉴别诊断
主要注意与肺丝虫和蛔虫的区别，因猪肺丝虫幼虫可以引起猪发生咳嗽。但在肺丝虫引起的咳嗽时，可于粪便中检出虫卵或幼虫，剖检时可在支气管内发现虫体，并在膈叶的后缘形成病变和剪开时见到虫体。蛔虫幼虫所引起的咳嗽，数天内逐渐消失，无气喘症状。特别应注意与猪传染性胸膜肺炎相区别。
