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因脑脊髓炎死亡的病猪剖检可见脑膜水肿，脑膜和脑血管充血，心肌和骨骼肌稍有萎缩。其他脏器无肉眼可见变化。肠黏膜无特异性病变。
组织学病变主要分布于神经灰质中，脊髓腹角、小脑皮质、间脑等处最明显。
其主要特征是神经细胞变性、坏死，有噬神经细胞结节形成，血管周围淋巴细胞浸润，形成淋巴细胞套。
早期主要侵害颈部脊髓，而后发展到胸、腰和尾部脊髓。大脑的病变较轻微。
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