根据本病发生的规律和特点，消灭传播媒介，增强猪只特异性抵抗力和加强管理是控制本病的主要环节和措施。
从发病特点看，消灭传播媒介是预防和控制乙脑流行的根本措施，各饲养单位，在蚊虫孳生和繁殖季节前，应开展防蚊灭蚊的工作，搞好猪舍、环境的清洁卫生工作，填平坑、沟等易积水的地方，铲除蚊虫孳生场所，并在猪舍及周围定期喷撒灭蚊药液。
防治措施：接种乙脑疫苗
种猪于6～7月龄(配种前)或蚊虫出现前20～30日注射疫苗两次(间隔10～15日)
经产母猪及成年公猪每年注射2次，每次2mL
在乙型脑炎重疫区，为了提高防疫密度，切断传染链锁，对其他类型猪群也应进行预防接种。本疫苗免疫期为10个月。我国还有用仓鼠肾细胞培养的活疫苗，可供猪只预防乙脑。在流行期前1～2个月，皮下注射，可收到较好效果。
猪患流行性乙型脑炎，无特殊治疗办法，对猪来说也无治疗必要，多为隐性感染，一旦确诊或疑为病猪时，应采取果断的淘汰措施。
