猪自然感染轮状病毒后，可产生循环抗体(IgG与IgM)和分泌性抗体(sIgA)，但提供保护作用的抗体是血液、肠黏膜及乳汁中的分泌型IgA(sIgA)。但乳中的母源抗体很可能会干扰经口免疫的轮状病毒的复制。循环抗体不能保护仔猪免受轮状病毒感染。
疫苗与免疫途径是影响免疫效果的主要因素。活病毒疫苗经口免疫是最为有效的免疫方法，可显著诱导肠道黏膜产生中和抗体IgA与记忆性B细胞，并提供对强毒攻击的免疫保护。
非复制型病毒疫苗(灭活病毒或类病毒颗粒VLP)及非消化道免疫途径(肌肉注射、腹腔注射及鼻黏膜免疫等)不能诱导有效的保护性免疫反应。
综合上述疫苗与免疫途径的联合接种方案可提供更好的免疫保护。首免用活病毒疫苗经口免疫，加强免疫由非消化道途径用非复制性病毒疫苗配以适当佐剂接种，获得的免疫效果显著高于各疫苗的单独接种。
已证明轮状病毒的免疫具有血清型特异性。VP4和VP7是两种重要的保护性抗原。除具有血清型特异性的抗原表位外，这些蛋白还具有异型抗原表位，但异型免疫的免疫效果不如同型毒株好。
通过利用两种不同血清型的VP4和VP7基因构建重组病毒或重组蛋白亚单位疫苗，可望诱导仔猪产生针对两种血清型的免疫力。
猪轮状病毒感染尚无特效治疗药。通过加强管理和抗生素治疗可以减少由轮状病毒和继发细菌感染引起的死亡。
自由饮用含葡萄糖-甘氨酸的电解质流液，或静脉注射葡萄糖盐水和碳酸氢钠溶液，可最大限度地防止脱水与酸中毒。
保持良好的周围环境，减少贼风和温度的波动。在持续存在断奶后腹泻且死亡率又高的猪场，饲喂高能断乳饲料可成功地降低发病率和死亡率。
预防主要依靠加强饲养管理，如搞好清洁卫生与消毒，遵循“全进全出”的管理模式，仔猪尽早吃初乳，不能早断乳。严格执行兽医一般防疫措施，增强母猪和仔猪的抗病力。母猪免疫接种可以保护新生仔猪免受感染。
目前，市场上有针对母猪和哺育猪免疫用的轮状病毒活毒苗和灭活苗供应。据报道能给仔猪提供有效的免疫保护。各种新型疫苗如亚单位疫苗等正在研制之中。
