根据流行病学特点、临诊症状和病理剖检变化可做出初步诊断。
目前，在规模化猪场疾病多而复杂，特别是呼吸道疾病十分突出，猪流感是呼吸道疾病综合征的原发性疾病。猪流感在临诊上常常表现不典型，更因为并发或继发感染存在而使其临诊症状变得复杂。因此，实验室诊断和检测流感病毒是十分必要的。
1、病原分离与鉴定
可采取发病2～3日急性病猪的鼻腔分泌物、气管或支气管渗出液，也可采取急性病死猪的脾脏、肝脏、肺脏、肺区淋巴结等组织，进行猪流感病毒的分离。病料加抗生素处理后可接种9～11日龄鸡胚羊膜腔和尿囊腔中，或MDCK细胞。37℃孵育3～4天，收集尿囊液和羊膜腔液，用血凝(HA)和血凝抑制试验(HA)鉴定病毒的血清亚型。
2、抗体检测
通过检测猪血清抗体可以确诊猪流感，最常用的血清学方法是血凝抑制试验。一般采用双份血清，第一份血清样本采于发病猪群的急性期，第二份血清采于发病后2～3周恢复期。如果恢复期血清中的HI抗体效价比急性期血清高4倍，即可诊断为猪流感。
3、猪流感病毒的检测
可以采用RT-PCR直接检测病料中的猪流感病毒。此外，也可应用抗原捕获ELISA、IFA、免疫组化等技术检测分泌物或组织中的猪流感病毒。 imuyi.com
鉴别诊断应与猪气喘病、猪传染性胸膜肺炎、猪繁殖与呼吸综合征、猪肺疫等相区别。
