猪流感发病猪群的病程、病情及严重程度与猪流感病毒毒株、猪的年龄与免疫状态、环境因素、继发或并发感染有关。
不同年龄、性别和品种的猪均有易感性。一年四季均可发生，但其流行有明显的季节性，天气多变的早春、初秋及冬季较易发生。
病猪、带毒猪和康复猪是传染源。主要通过飞沫经呼吸道传播，传播较迅速，2～3天内可波及全群。该病发病率高、病死率低，通常不超过4%，但猪流感病毒感染常引起肺部的继发感染。
常见混合感染的病原体有 PRRSV、猪呼吸道冠状病毒(PRCV)、胸膜肺炎放线杆菌(APP)、支气管败血波氏杆菌、多杀性巴氏杆菌、副猪嗜血杆菌、猪肺炎支原体、猪链球菌等。
继发感染会使病程延长、病情加重，甚至导致死亡，引起发病猪群的死亡率升高。猪流感还可以引起妊娠母猪流产，新生仔猪死亡。
