经口人工感染的潜伏期，新生仔猪为15～30h，肥育猪为2天，自然感染可能稍长些。
猪流行性腹泻的主要临诊症状为水样腹泻，或者伴随呕吐。猪流行性腹泻病常以暴发性腹泻的形式发生在非免疫断奶仔猪(I型)或各种年龄的猪(Ⅱ型)。
病猪表现出呕吐、腹泻和脱水，与猪传染性胃肠炎相似，但程度较轻、传播稍慢。粪稀如水，呈灰黄色或灰色。呕吐多发生于吃食或吮乳后。
少数病猪出现体温升高1～2℃，精神沉郁，食欲减退或不食，尤其是繁殖种猪。症状的轻重随年龄的大小而有差异，年龄越小，症状越重，1周内新生仔猪常于腹泻后2～4天内因脱水而死亡，病死率可达50%。
断奶猪、肥育猪以及母猪常呈现沉郁和厌食症状，持续腹泻4～7天，逐渐恢复正常。
成年猪仅表现沉郁、厌食、呕吐等症状，如果没有继发其他疾病且护理得当，猪很少发生死亡。
